Le tissu du thymus est subdivisé en cortex et médullaire.

Ce schéma représente la circulation sanguine du lobule en haut et à droite. Une artère, en provenance d’un septum, traverse le cortex et entre dans la médullaire. Elle se divise en artérioles puis en capillaires qui forment des anses qui retournent vers la médullaire. Ces capillaires s’ouvrent dans des veinules et des veines qui rejoignent les septums.

D’autres artérioles situées dans la capsule donnent des capillaires qui entrent dans le cortex et se dirigent directement vers les veinules et veines de la médullaire.